在日本读书期间，周令飞慢慢与台湾留学生张纯华产生了爱情，但台湾当局知悉后，召回张纯华的父母并进行了一番劝说。张纯华的父亲只是一个商人，一听就害怕了，马上把张纯华叫回台湾，严禁她再去日本。半年后，张纯华才设法重返日本学习，与周令飞团聚。
而大陆方面也早开始注意他们了，并特别关注张纯华的政治面貌和接近周令飞的动机。当时已考虑让周令飞回国，并不排除采取组织措施强行将周令飞押解回国的可能。但这一切被周令飞提前知晓了。生于1953年的周令飞，性格与鲁迅有几分相像。用周海婴的话说，他个性极强，“自己认准的事情，非要达到目的不可”。在他的心中，一个中国男人和一个中国女人有恋爱结婚的自由，也有选择居住地的自由。既然大陆不能容忍，那就去台湾。
决定做出后，周令飞连在东京读书的妹妹都没有通知，就直接从日本飞到了台湾。临上飞机，周令飞向媒体发表了三点声明：第一、此举纯粹是为了爱情，没有其他目的；第二、此事与父母无关；第三、因为与台湾女子结婚，又鉴于两岸关系现状，宣布退出中国共产党。
周海婴声明断绝父子关系
为爱退党去台湾，在周令飞的心中纯属个人事件，但消息一传开，便成为媒体报道的焦点。港台报刊称周令飞是“海峡两岸第一个闯关者”，日本媒体称周令飞是“亡命”，台湾记者称他是“投奔自由”，大陆此时也谣传四起，其中一个流传颇广的版本是，周令飞去台湾是中了台湾军情机关的“美人计”，台湾女生张纯华是女特务。
周令飞的个人事件随后升级为政治事件，周海婴受到了极大的压力。他当时的上司----广电部部长吴冷西随后把他叫去，说周令飞属叛逆，政治影响极坏，并以党和组织的名义命令周海婴写一个声明，宣布与周令飞断绝父子关系，并向他宣布了三条纪律：第一、最近一个时间内不会见任何记者，尤其是外国记者，实在避不开的，可回答“无可奉告”；要表示已经跟儿子划清了界限，断绝了父子关系；第三、暂不出国。后来，他在单位阅读文件的资格被取消，全国人大主席团成员的资格也在未经有关法定程序、没有任何理由的情况下被取消，他夫人的教师工作也被剥夺，直到1986年恢复。
在台湾卖爆米花度日
周令飞的出走让周海婴夫妇伤透了脑筋。而身在台湾的周令飞生活也并不平顺，一度还因为来自大陆且是鲁迅后人的身份找不到工作。周令飞一开始在岳父开的百货公司做协理，但后来因为经济变化，生意每况愈下，百货公司最终破产。
在这种情况下，周令飞与张纯华自行就业，他们买了一台爆米花机，将爆好的米花批发给摊贩。鲁迅的孙子竟然落到了卖爆米花的地步，这当然是一大新闻！周海婴写道：“这事给那些无聊记者获悉，写文章拿我儿子当笑话，说什么想不到鲁迅的孙子竟落到在台北卖爆米花过日子的地步。但我儿子不以为然，心想我本分做生意，靠劳动吃饭，这给祖父丢什么脸？照样他干他的。”
但周海婴和张纯华最终靠自己的双手，创造了“一个虽不算富裕、却也舒适安逸的家”。后来廖承志对周海婴说，周令飞在台湾表现得很好。这对周令飞而言，可谓莫大的安慰。
